Çeşitli okulların müdürlük görevlerini yerine getirdi. Bakanlığın “Acil Psikolojik Müdahale” ekibinde ekip üyeliği ve takım liderliği sorumluluklarını üstlendi. Van Depremi ve Reyhanlı patlaması başta olmak üzere önemli afetlerin neredeyse tamamında sahada yer alarak afetzedelere psikolojik destek verdi. İntiharı önleme Derneği’yle birlikte, çocuk; ergen ve yetişkinlerde öz kıyımın engellenmesi için projeler geliştirdi, uygulanmasında bizzat görevler aldı. Akran zorbalığı hakkında da akademik çalışmalar kaleme aldı.

Hem İntiharı Önleme Derneği ile birlikte yaptığı çalışmaları, hem de akran zorbalığı ile ilgili verileri psikoloji kongrelerinde sunarak, bu konularda öncü işleri gerçekleştirdi. Kadın dernekleriyle; kadına yönelik şiddetin engellenmesi adına çalışmalar yaptı. Seminerler düzenledi. Taciz ve İstismar konuları hakkında eğitimler verdi. Formatörlük vazifesinde bulundu. Mahkemelerde bu konular ve suça sürüklenen çocuklar ile ilgili davalarda bilirkişilik görevlerini yerine getirdi. Travma ve EMDR konusunda uzmanlaşarak travmaların tanılama ve tedavi edilmesi için faaliyet göstermektedir.

29 yıllık meslek hayatını “Durmaksızın kendini geliştirme” parolasıyla sürdürmektedir. Aygün Özkapu 29 yılı aşkın meslek hayatından edindiği deneyimlerin ardından geliştirdiği kendine has “Şifa Kapusu” sistemi ile hem daha hızlı iyilik haline ulaştığını; hem de sorunları daha kalıcı bir şekilde çözümlediğini fark etti. İnsanların bugünleri, dünlerine sıkı sıkıya bağlıydı ve zaman zaman Bilinçaltı sorunlarını çözmenin yanı sıra; kişinin enerjisel bazı alanlarının temizlenmesi gerektiğine inanıyordu. “Şifa Kapusu” sistemi böyle bir gereksinimle oluşturuldu. Bu yöntem sayesinde kişinin enerjisel atasal geçişleri de çözüme kavuşturulduğu gibi; Kurân’da da işaret edilen negatif enerjilerden kurtulması da sağlanıyordu. Şifa Kapusu sistemi bunu hem mümkün hem de anlaşılabilir hale getirmeyi amaçlamaktadır.